La Unidad Académica La Rioja fue creada en 1986, mediante resolución del Consejo Superior Universitario del Rectorado con dependencia directa de la Facultad Regional Mendoza.
Gracias a ello, los estudiantes locales y de provincias limítrofes tuvieron la opción de cursar la carrera Ingeniería Electromecánica.
En 1993 se amplió la oferta educativa con la incorporación de la carrera Ingeniería en Construcciones, de igual duración que la anterior.
El 19 de diciembre de 2005 recibe el estatus de Facultad Regional.